福建三博福能脑科医院门诊部位于综合大楼二层，设有17间诊室，其中2间VIP诊室，开设神经内科、神经外科、脊柱脊髓、电生理、心理、疼痛及康复等专科门诊，首都医科大学附属三博脑科医院栾国明、于春江、石祥恩、林志雄、王保国、闫长祥、吴斌、江涛教授等一批国内知名的神经医学专家定期来院坐诊。
门诊配备以下先进医疗设备：德国SIEMENS SOMATOM perspective 64排128层螺旋CT、德国SIEMENS MAGNETOM Skyra3.0T核磁共振、德国SIEMENS Artis zee Ⅲ ceiling数字减影血管造影机(DSA)、TMS经颅磁刺激仪、经颅多普勒彩超（TCD）、美国Cosman射频消融治疗仪、美国Nicolet 8通道肌电/诱发电位仪、Nicolet视频脑电图仪等。
        门诊就诊按以下流程进行：挂号处挂号→各科导诊台分诊排队→候诊区候诊→诊室内就诊→收费处缴费→处置（包括辅助检查、手术或住院等）。急危重患者请直接到急诊科挂号就诊。如果对门诊服务有建议及投诉，可到门诊办公室进行联系，也可拨打投诉电话，详见门诊大厅。
        医院技术源自首都，配备进口高精尖设备，以“用心服务”为标准，“博医、博教、博研”为愿景，秉持“福相伴 能永远”的发展理念，旨在把福建省的优质资源和北京的神经专科技术结合，打造一家“民生医院”，更好地服务当地民众，缓解福建及周边省份神经疾病患者的就医难题。